国科捜は過去の鑑定結果を覆し、マンサンが生きていることを公式的に発表する。マンサンは今回の事件とどう関わっているのか？そしてボディーパッカー事件とのつながりは何か？“ドクターK”なる人物は誰なのか？一方、スヨンはチョルから娘ソヒョンの体に虐待の痕跡があったことを告げられ、犯人を捕まえようと奮闘する。

マンサンに懸賞金がかけられ、検察のもとにはマンサンの目撃情報が次々に入ってくる。そんな中、ノ・ハンシン次長検事はカル部長にドクターKと手を切るよう忠告するが…。一方、楽しいはずの誕生日パーティーでソヒョンが何者かに誘拐されてしまう。一刻も早くソヒョンを救うため、東部地検は全力で捜査に乗り出す。

検察は国科捜と共に救出作戦を展開するが、誘拐犯は逃亡中の事故によりソヒョンの居場所を明らかにしないまま意識不明の重体に。身代金授受の過程で誘拐犯から送られてきた写真には、手足を縛られた状態で低温冷蔵庫に閉じ込められ眠っているソヒョンの姿が…。手がかりが少ない中、果たしてソヒョンを無事に救出できるのか？

ソヒョンの居場所を知る誘拐犯が意識を回復することなく死亡。ボムは犯人の遺体を解剖し、ソヒョン発見につながるヒントを探そうとする。解剖の結果、犯人は韓国系中国人であり、真犯人は別にいることが判明。低温冷蔵庫での生存可能時間が残り少なくなり捜査メンバーは焦りが募るが、ボムは冷静に解剖結果から推理を続ける。

検察が探し出した真犯人は、ソヒョンの居場所を把握していなかった。チョルは、誘拐犯の死に際の言葉に何か感づいたようで…。ボムの推理から居場所を特定した検察だが、ソヒョンは既に冷蔵庫から姿を消していた。絶望したスヨンは意識を失ってしまう。ボムは現場に残された痕跡から、ソヒョンを連れ去った人物を明らかにする。

誘拐の疑いはチョルに向けられるが、数時間後、チョルは自らソヒョンを連れて国科捜にやって来た。事件のいきさつを知っているソヒョンは、ショックのあまり誘拐されていた間の記憶を失っていた。淡々と取り調べを受けるチョルに、違和感を感じるソル。スヨン復帰記念パーティーが何故かボムの家で催されることになり…。

マンションの一室で遺体のない殺人現場を発見する検察。殺人事件としてその部屋に住む統合失調症の男ハンスに疑いがかけられる。いつもは動かないノ次長検事が珍しく現場にやって来るが、ボムとの相性が悪いようで…。近所の住人の証言から、キルジャの遺体らしきものが発見される。一方、ハンスは息子を残したまま逃亡を図る。

遺体らしきものの正体は豚足で、遺体発見の宣言をした検察は大恥をかきカル部長は監察に呼び出される。ハンスを見つけた検察は崖まで追い込み説得を試みるが、ハンスは崖から飛び降りてしまう。一方、ボムは細かい検証を続け、キルジャの遺体の場所を突き止める。キルジャの遺体解剖が始まるが、犯人はいったい誰なのか。

検察は妹のもとへ向かったハンスを待ち伏せし、逮捕することに成功する。しかし、統合失調症患者であるハンスの取り調べは思うように進まず、プレッシャーをかけられたカル部長は名誉挽回に勤しむ。息子のドンウは父親の無実を願うが、妹は兄と縁を切りたいと怒りをあらわにする。頼みの綱であったキルジャの解剖結果は…。

カル部長は一刻も早く手柄をあげようと、証拠不十分のままハンスの身元を公表する。ボムはキルジャの診療記録を調べ、１つの手術記録に目を留める。死亡届の手続きをしたキルジャの娘は生活保護費の話に疑問を持ち…。解剖により少しずつ得た情報から、国科捜は予想外の結論を発表する。果たして事件の真相はいったい？

スヨン親子とピクニックに出かけたチョルは、ソヒョンの描いた絵を見て封印していた記憶を思い出してしまう。そんなチョルに仕事を持ってきたカル部長がボムに気をつけろと忠告するが、チョルはボムとの接触を図る。一方、モーテルでの事件を調べていたボムは、防犯カメラに映る犯人に被角血管腫らしきものがあることに気づく。

国税庁の調査官であるヨンスが毒蛇に噛まれ死亡した。しかし、ヨンスと親しくしていたジハンは他殺だと主張し、ボムに解剖を依頼する。星振グループが関わっている可能性があると聞いたボムは、ヨンスの解剖を引き受ける。一方、ソルは星振グループの不正隠しのネタとは知らず、芸能人の性的暴行事件を担当することに。

ヨンスの解剖はボムへの挑戦状とも思えるほどに困難を極めた。ボムがチョルに疑いを持っていると知ったジハンはチョルを訪ねて病院に向かうが…。性的暴行事件も、重要な証拠となる液体エクスタシーを検出できずに捜査は行き詰まる。ジハンはチョルの家宅捜索令状を申請するが、ノ次長検事とカル部長によって妨害される。

ジハンは令状がないままボムらと家宅捜査に踏み込む。生活感のない不気味な部屋には、一連の事件の詳細なスケッチが描かれた手帳と遺伝性疾患の薬があった。チョルとドクターKが同一人物だという事実にスヨンは動揺する。性的暴行事件は証拠があがらない中、ある動画の流出で逆に被害者のジヘが袋叩きにされる展開に。

徐々にドクターKの謎に迫るジハンに対し、カル部長は権力でジハンの行動をねじ伏せようとする。ボムの助言によってサリーは液体エクスタシーの検出に成功したが、何故かジヘがテレビに出演し今までの話は嘘だったと告白する。ヨンスの解剖を止められたボムは、針の先についたヨンスの組織片から真相を解明しようと試みる。

カル部長の命令を無視し一人で筏橋のチョルの生家にやってきたジハン。そんなジハンからボムに電話がかかってくるが…。ジハンが不在の中、カル部長の企みでジハンの懲戒委員会が開かれる。ジハンから東部地検は信じるなと言われたソルは、慎重に捜査を続ける。ボムはサリーに血液検査を依頼するが、その意図は…？

ボムは懲戒委員会に出向き、ヨンスの死はヘビ毒を利用した計画的な他殺だと発表する。免職を免れたジハンはチョルの母親殺しの事件帳簿を手に入れ、カル部長が関わっていると確信する。一方、証拠を掴んだ東部地検はソルの機転のきいた方法で令状を手に入れることができ、アイドル カン・ジュンソの家宅捜査に踏み切るが…。

ジハンが自分の過去を知ったと気づいたカル部長は、チョルの父親の家だと嘘を付き、ある屋敷にチョルとジハンをおびき寄せる。偽の父親を殺そうとするチョルとそれを阻止するジハン。2人はカル部長が雇った暗殺者によって撃たれ、崖から落ちてしまう。一方、ジュンソ宅の水槽の魚から液体エクスタシーが検出される。

ジュンソの逮捕により麻薬密売の捜査が広がる中、コカインの大量購入にやって来たのは、なんとマンサンだった。カル部長は後ろ盾のなくなったマンサンを脅し、模範検事賞で表彰される。ジハンは無事に発見され一命を取りとめたが、ボムにチョルの最後の言葉を託して東部地検を去る。残されたソルは監察班に誘われ…。

暴力団員ヤン・チョルギを釈放させるようにウヨンから命じられたテギョン。法廷に現れた検事はテギョンの元恋人ソ・ヨナだった。彼女はヤンがある殺人事件の容疑者だと言い出す。それは７年前に起きた未解決事件だった。

ヨナはヤンが７年前に起きたアヒョン事件の容疑者だと主張、同時刻に現場を訪れた宅配員が目撃者かもしれないと告げる。その宅配員こそ、テギョンの弟テジュだった。テジュはその翌日、交通事故で死亡していた…。

事件を調べ始めたテギョンは当時の防犯カメラにレイプ事件の被害者ヨンミが映っているのを見つける。だがヨンミはテギョンに協力しようとしない。一方、ヤンは事件への関与を匂わせてテギョンを挑発する。

ヤンとウヨンの関係を怪しんだテギョンは、出所したヤンの周辺を調べ始める。そんな中、ウファ山でアヒョン事件とよく似た手口の事件が発生する。ヨナはヤンの仕業と断定し、指名手配に踏み切るが…。

ヤンを逃がしたテギョンに激怒するヨナ。再度ヨンミを訪ねたテギョンはテジュが配達した荷物の中身がUSBだったと知る。ヤンは自分が隠し持つテジュの携帯を見れば真相がわかると、テギョンに取引を持ち掛ける

死体で発見されたヤンは自殺として処理される。ウヨンはヤンがテジュを殺したと言い出す。７年前のことで、自分もヤンから脅されたというウヨン。弟のための復讐が無意味だったのではと、不安になるテギョンだが…。

携帯会社チョンジンの社員が危険な薬品のせいで視力を失い会社を訴える。ウヨンはテギョンに被害者の弁護を依頼。一方、ヨナは今までの事件がチャン・エンタから始まったとみて調査を始めたところウヨンに行き着く。

テギョンと事件の話をした直後、事故に遭ったヨナ。テギョンはヨナに手を引くように忠告するが、彼女はむしろ、チャン・エンタの社長を呼び出して取引を持ち掛ける。そんなヨナが次第に疎ましくなるウヨンは…。

チョンジンの副会長タク・スホから訴訟の取り下げを要求されたテギョン。しかもウヨンも承知だった。テギョンはウヨンへの不信感を露わにする。その頃、ヨナはアヒョンとウファ山事件の共通点を掘り下げていた。

被害者にハサミを向けるスホ。本当に失明したのかどうか確かめただけ、というスホの言葉に疑問を抱くテギョン。その頃、チャン社長は嫌がるヨンミに、またしても怪しい接待を強要していた。

ヨンミを呼び出したヨナは事件の話を聞き出そうとするが、彼女は何を恐れてか、口を開こうとしない。テギョンとウヨンに再度訴訟の取り下げを要求するスホ。そんなスホに真実を明らかにすると告げるテギョン。