ある夜、青柳靖（吹越満）は突然、見知らぬ少女に「助けて！」と抱きつかれてビックリ。一緒にいた恋人の垣内妙子（遠藤久美子）、矢沢英明（田口浩正）も驚くが、3人をさらに驚愕させたのは、少女に連れて行かれた一軒家にあった男性の遺体だった。

裏道で男性の遺体が見つかり、特捜班が捜査を開始する。浅輪直樹（井ノ原快彦）と新藤亮（山田裕貴）は、被害者・高宮良介（朝倉伸二）が所持していたレシートを手がかりに、一軒の定食店に向かう。店主の吉田かおり（町田マリー）は高宮が事件当日の夜、3時間ほど店にいたと証言。滞在時間が長かったのは、かおりのひとり息子で小学6年生の一輝（齋藤優聖）と数字パズルをしていたからだと話す。

ビル清掃員・宮川文子（田島令子）が自宅リビングで刺殺されているのが見つかり、浅輪直樹（井ノ原快彦）ら特捜班が臨場する。無断欠勤した文子の様子を見に来て窓から遺体を発見した同僚によると、文子には大手商社でバリバリ働く娘がいるものの家を出ており、現在はひとり暮らしとのことだった。ところが、誰もいないはずの2階から物音が聞こえてきた。

路地裏で不動産会社の社員・脇坂芳樹（永倉大輔）の遺体が見つかった。何者かに突き飛ばされ、地面の石で後頭部を強打したものと思われたが、臨場した浅輪直樹（井ノ原快彦）と新藤亮（山田裕貴）は、路地裏の壁に足跡がついているのを発見。

ある朝、掃除当番にもかかわらず登庁してこない青柳靖（吹越満）と矢沢英明（田口浩正）に班長・国木田誠二（中村梅雀）が苛立っていると、新藤亮（山田裕貴）がスマートフォン片手に大騒ぎで出勤してきた。新藤はその日、朝から、お気に入りのアイドル・ルリ（小池美由）のファンミーティングバスツアーの生配信をチェックしていたのだが、なんと参加者の中に青柳と矢沢の姿を見つけたのだ。

ベテラン鑑識官・猪狩哲治（伊東四朗）が殺人事件の容疑者として連行され、浅輪直樹（井ノ原快彦）は複雑な思いを抱きながら取調室で対峙していた…。猪狩は所轄署で黙秘を貫きとおしており、長年親交のある直樹ならば口を割るのではないかという中原圭一郎管理官（小須田康人）の判断で、特捜班に捜査がまわってきたのだ。

妻・倫子（中越典子）の誕生日に休みを取り、夫婦で港の見える公園に出かけた浅輪直樹（井ノ原快彦）。その日1日、倫子と過ごすつもりだったが、なんと到着した矢先、海面に浮かぶ男性の遺体を発見してしまう。遺体の身元は、投資会社の役員・古賀武久（木下政治）と判明。死後数日が経過しており、ひとりで釣りをしている最中に誤って転落死したというのが所轄署の見解だった。

車椅子生活となった村瀬健吾（津田寛治）のため、バリアフリーの物件を探していた小宮山志保（羽田美智子）はパトカーのサイレンから近くで事件が起きたことを知り、現場に駆けつける。事件が起きた高架下にはすでに捜査一課が到着していたが、志保は運び出されてきた被害者の遺体から、“ある香り”がするのに気づく。

恋愛経験ほぼゼロの超箱入り娘・村上舞衣子（葵わかな）は、会社経営者の父・源一郎（吹越満）のススメでお見合いをすることに。相手は20歳年上のバツイチの男性ということもあり、あまり気が進まない舞衣子だったが、花里晴海（竹財輝之助）にいざ会ってみると大人の雰囲気漂わせるステキな男性で…。

ついに妻になったピュア女子・舞衣子（葵わかな）は、職場の上司の竹田紫（河井青葉）夫婦をホームパーティに誘う。晴海（竹財輝之助）は自慢の料理でおもてなし、舞衣子は改めて優しくてカッコイイ晴海の魅力を実感…。 一方で、こんなに素敵な晴海と離婚した理由が気になるように…。そんな中、晴海に前妻・美雪（松本若菜）から着信が。連絡取っていないと言っていたのに…。

舞衣子（葵わかな）は、晴海（竹財輝之助）に初めて嘘をついてしまう。幼い頃から大事にしているカメのぬいぐるみを探しているなんて、子供っぽくて言えない…。一方、仕事では大きなプレゼンに参加することになり、新進気鋭の空間デザイナーのショーン・一ノ瀬（吉野北人）と出会うも… え、もしかして大学の同級生の××××！？

「俺じゃダメ？」2人きりになったオフィスで、ショーン（吉野北人）は舞衣子（葵わかな）の肩に手をのせ…急接近！？一方、晴海（竹財輝之助）は、舞衣子に掛けた電話にショーンが出たことにヤキモキ…。そして舞衣子は、改めて晴海に自分と結婚した理由を聞いてみたところ、予想外の返答に超絶ショック！プレゼンに向け、準備を進める舞衣子とショーン。

「俺じゃダメ？」2人きりになったオフィスで、ショーン（吉野北人）は舞衣子（葵わかな）の肩に手をのせ…急接近！？一方、晴海（竹財輝之助）は、舞衣子に掛けた電話にショーンが出たことにヤキモキ・・・。そして舞衣子は、改めて晴海に自分と結婚した理由を聞いてみたところ、予想外の返答に超絶ショック！プレゼンに向け、準備を進める舞衣子とショーン。

目も合わせない晴海（竹財輝之助）と理音（小野寺晃良）の様子を見て、舞衣子（葵わかな）は別荘でバーベキューを提案！父・源一郎（吹越満）と秘書の崎田（徳井優）一家も交え、久々に穏やかでほっこりした1日…。しかし、晴海と理音の関係はさらに悪化！？ そして、舞衣子もある決断をし――！？ピュアラブな新婚生活も大波乱の展開に！？

晴海（竹財輝之助）が目を覚ますと、枕元には「実家に帰らせていただきます」と舞衣子（葵わかな）からの置き手紙。理音（小野寺晃良）を追い出した理由をあえて言わなかったが、こんな事態になると思っておらず・・・。電話に出ない舞衣子ときちんと話をするため、晴海は実家に迎えに行くが・・・。一方、夜の屋上で舞衣子は理音から「舞衣子のことが好き」と禁断の告白！？

「舞衣子のことが好きなんだよ」真剣な表情で理音（小野寺晃良）に告白された舞衣子（葵わかな）は、「晴海（竹財輝之助）と縁を切るか、自分と縁を切るか」究極の選択を迫られる・・・。翌日、理音の晴海に対するある誤解を解くため、舞衣子は晴海に○○を提案！そして、レストランには晴海と舞衣子、晴海の元嫁・美雪（松本若菜）と・・・、理音が大集合！？前代未聞の４者会談が幕開ける――！？

東京のとある郊外に建つマンション。そこに、中越チカラ（松本潤）と妻の灯（上戸彩）、そして娘の愛理（鎌田英怜奈）と息子の高太郎（大平洋介）という1組の家族が移り住んでくる。優柔不断で困っている人を放っておけない性格の夫とテキパキしっかり者の妻に、ちょっぴり大人びた姉と無邪気な弟――そんな一家がやってきたマンションには、とても個性豊かな住人たちが暮らしていた。

ある朝、のんびり朝食をとっていた中越チカラ（松本潤）一家は、上の部屋から「助けて！」という声を聞く。様子を見に行こうかどうしようか…とチカラが中腰になって悩んでいたところ、「どうせ行くんでしょ」と灯（上戸彩）に背中を押され、チカラは上の階へ駆けつける。すると、廊下に出てきた503号室の柏木清江（風吹ジュン）が「うちに知らない男がいるの。

ある夜、突然中越家にやってきた303号室のマリア（ソニン）。「アブない男におそわれたので、かくまってほしい」という彼女を中越チカラ（松本潤）と灯（上戸彩）が部屋に招き入れたところに、「マリアの客だ」と名乗る男が乗り込んでくる！　どうやらマリアは303号室でベトナム式のエステ店を営んでいるようで、男はそこを“いやらしいサービスをする店”と勘違いしてやってきた上、何もサービスされないことに逆上した様子…。

お隣の道尾頼子（松嶋菜々子）に「とっても困ってるの。助けてくれる？」と相談された中越チカラ（松本潤）が部屋を訪ねると、そこには灯（上戸彩）と娘の愛理（鎌田英怜奈）、さらには柏木清江（風吹ジュン）やマリア（ソニン）、木次達代（映美くらら）の姿も。戸惑う一同に、黒ずくめの服を着た頼子はこう告げる。――「今日は皆さんをお救いするために集まっていただきました」達代は夫・学（小澤征悦）のこと、マリアはこれからの日本での暮らしのこと、愛理は恋愛のこと、とそれぞれが悩んでいることを次々と言い当てていく頼子。

中越チカラ（松本潤）、灯（上戸彩）、道尾頼子（松嶋菜々子）らが集まり、柏木託也（長尾謙杜）の大学合格祝いをしている中、管理人の星譲（浅野和之）が現れ、衝撃的な事実を告げる。SNSに上げられた、「連続幼児殺人事件の容疑者・少年Aを発見」という情報――そこにはチカラたちが住むマンションの写真まで付いており、星は「やはり601号室の上条（清水尋也）さんが少年Aだったんですよ」と声を潜める。星から、“マンションのリーダー”として上条に直接確認してみてほしい、と頼まれてしまったチカラ。

いつものように中越チカラ（松本潤）が向かいのカフェから何気なくマンションを見ていると、お隣の木次家に異変が…。チカラが好美（古川凛）に渡した連絡用の手旗が、ついに学（小澤征悦）に見つかってしまったのだ！好美が激しく叱責され、また虐待を受けるのではないかと、チカラは慌てて木次家に駆けつけるが、逆に学から「人が虐待してるって決めつけやがって」と声を荒らげられてしまう。チカラは怯える達代（映美くらら）と好美の様子に、このままでは2人に被害が及んでしまうと、ひとまずは引き上げるが…。

「これ以上、チカラくんといたくないの」――そう告げて実家に戻ってしまった妻の灯（上戸彩）を呆然と見送るしかなかった中越チカラ（松本潤）。お隣さんや他の住人にはあっても、我が家には何の問題もないと思っていたチカラは、なぜ灯が出ていってしまったのか、見当もつかないのだった。

家出中の妻・灯（上戸彩）から出された3つの課題――「仕事を辞めていいのか」「愛理（鎌田英怜奈）を怒鳴ったり叩いたりしていいのか」「高太郎（大平洋介）を塾に行かせていもいいのか」――が両肩に重くのしかかり、まったく仕事に集中できない中越チカラ（松本潤）。子どもたちに学校での様子などをさり気なく聞いてみるが、どちらの問題も解決には時間がかかりそうな上、道尾頼子（松嶋菜々子）やマリア（ソニン）らマンションの住人たちからも総スカンを食らっていることを思い出し、ますます落ち込んでしまうのだった。

マンション内で火事が起きたとの連絡が入り、表に避難した中越チカラ（松本潤）たち。幸いボヤで済むが、管理人の星譲（浅野和之）によると、どうやら火元となった603号室の住人・小日向（藤本隆宏）は自分で火をつけたとのこと…。ここのところマンション内のトラブルメーカーとして名前が挙がっていただけに、道尾頼子（松嶋菜々子）は「理事会を開いて即刻出ていってもらいましょう」と息巻く。

高校2年生の片切友一（浮所飛貴）は、母の教えを守って、幼い頃から“お金よりも友達を大切にする”をモットーに、明るく学生生活を送っていた。両親を亡くして以来、貧乏生活を強いられている友一だが、どうしても友だちと一緒に参加したいと、必死にアルバイトをして修学旅行費を捻出。しかしある日、クラスメイトの修学旅行費200万円が盗まれる事件がぼっ発する…！

片切友一（浮所飛貴）は、仲のいい高校のクラスメイト、美笠天智（佐藤龍我）、四部誠（井上瑞稀）、沢良宜志法（久保田紗友）、心木ゆとり（横田真悠）とともに何者かに拉致され、『トモダチゲーム』に参加することになる。友情さえあれば簡単にクリアできるゲームのはずだったのに、この中の誰かが背負った莫大な借金が絡んできたことで、第1ゲーム開始早々、裏切り者が出現！

友達の秘密を暴露して自分の借金を減らすという壮絶な第2ゲーム『暴露スゴロク』が、ついに最終ピリオドを迎える。片切友一（浮所飛貴）は、沢良宜志法（久保田紗友）を憎んでいる美笠天智（佐藤龍我）が、自分たちをこの『トモダチゲーム』に巻き込んだ張本人だと気づく。

片切友一（浮所飛貴）と美笠天智（佐藤龍我）、そして素性を隠し潜入したトモダチゲーム運営・水瀬マリア（片山友希）の3人と、バスケ部の先輩後輩で構成され固い結束で結ばれた5人が争う第3ゲーム『友情かくれんぼ』がスタートした。友達同士が協力して相手チームの友情を壊すこのゲームは、それぞれ選出した隠れ役ひとりが広大の森のどこかに隠れ、探し役となった残りのメンバーが相手の隠れ役を見つけたら即終了、という対戦形式の変則的なかくれんぼ。

第3ゲームをクリアした片切友一（浮所飛貴）と美笠天智（佐藤龍我）。沢良宜志法（久保田紗友）がトモダチゲームに関わっているのではないかと疑う天智は、会場から出たら本人に問いただそうと心に決めていた。しかし、学校の前でワゴン車から放り出された2人の前に心木ゆとり（横田真悠）が現れ、四部誠（井上瑞稀）と志法の2人が消えたと告げる。