アマタがミコノに告白できず落ち込んでいる様子をみたアンディが、トキメキイベントを計画する。

ミカゲはカグラに1万2千年前の記憶を思い出させるため、再びカグラをヴェーガへ送り込もうとする。

グニスを撃破され地球に降り立ったジンは、レア・イグラーの探索及び機械天使の奪取を命じられる。

“穴”を掘るのが生き甲斐と言うアンディと、“穴”を毛嫌いをするMIX。反発し合う二人の合体は…!?

アンディが穴で発掘した謎の古文書、それは伝説の「双星の書」なのか、それとも…。

アンディは注目を集めるため、消えたエレメントの生徒「恐怖のぬいぐるみ」の話をし始めた。その夜…。

アマタとミコノの前に突然現れたカグラは、ミコノの匂いを嗅ぎ「臭い」と言い放つ。

アクエリオンの謎を解明する為に旅をしていた不動総司令とクレア理事長がネオディーバに帰還した。

エレメント能力がないと判断されたミコノは、もやもやしたものを抱きながら学園を去る決意をする。

禁断の男女合体を成したアマタとミコノ。彼らはネオディーヴァが運営する聖天使学園に連れてこられる。